Фамилия Кептюха — редкий случай, когда прозвище перешло в фамилию почти без изменений, сохранив свою исходную форму. В ней нет типичных фамильных суффиксов вроде -ов или -ин, а значит, перед нами так называемая «неоформленная» фамилия, которая закрепилась в том виде, в каком её дали человеку. Такие фамилии чаще встречаются на Украине и в Беларуси, где прозвища нередко становились родовыми именами без добавления суффикса принадлежности.

Основа фамилии — слово «кептюх», которое в украинских и южнорусских говорах имеет два значения. Первое — это мешок, куль, особенно для зерна или муки. Второе, переносное — неповоротливый, неуклюжий или нерасторопный человек, которого в быту называли «кептюхом» за сходство с тяжелым мешком. Слово это, скорее всего, тюркского происхождения (ср. тат. «киптә» — мешок) и проникло в славянские диалекты через контакты с кочевыми народами.

Таким образом, первый носитель фамилии Кептюха мог получить прозвище либо по роду занятий — например, как мельник или торговец, постоянно имевший дело с мешками, либо по характерной внешности или манере поведения. Вторая версия кажется более вероятной: прозвища, данные по физическим или поведенческим чертам, в крестьянской среде закреплялись чаще, чем профессиональные.

Географически фамилия тяготеет к западноукраинским и белорусским землям, а также к пограничным с ними районам России. В современных документах она встречается редко, что говорит о её локальном происхождении — скорее всего, от одного прозвища, которое дали в конкретном селе или хуторе, а затем оно стало фамилией для нескольких семей.

Интересно, что в отличие от большинства русских фамилий на -а, которые обычно имеют корень в женском роде (Кузьма — Кузьмин), Кептюха — это мужское прозвище, и фамилия не склоняется по женскому роду. То есть женщина Кептюха — это не «дочь Кептюхи», а сама по себе «Кептюха», что ещё раз подчеркивает её прозвищное происхождение.