Фамилия Кернакаускас (в оригинале Cernakauskas) — литовская по форме, но славянская по корню. Её основа восходит к прозвищу Чернак, которое в древнерусской и белорусской среде давали человеку со смуглой кожей, чёрными волосами или тёмной одеждой. Иногда прозвище несло переносный смысл — «злой», «недобрый», а в социальном контексте могло означать человека, платящего подати и выполняющего повинности, в отличие от «белого», то есть обеленного, освобождённого от тягла. Литовский суффикс -аускас (аналог славянского -ский) указывает на принадлежность к роду или месту: буквально «сын Чернака» или «чернаковский».

По другой версии, фамилия связана с топонимом Чернаки — деревней в Брестской области Белоруссии. Предок, переселившийся из этого селения в Литву, мог получить фамилию по названию родины. Такая модель — переоформление славянского названия в литовский патроним — типична для пограничных регионов, где шёл активный обмен населением.

Обратите внимание на буквенное расхождение: в литовском написании фамилия начинается с C (читается как «ц»), а в русской передаче — с К. Это не ошибка, а следствие разной фонетики: литовцы произносят Cernakauskas с твёрдым «ц», а русские адаптируют как «кер» по аналогии с другими заимствованиями. Встречаются варианты Чернакаускас и Кернакаускас — оба отражают одну фамилию в разных языковых средах.

Словообразовательная модель проста: корень черн- (тёмный цвет) + уменьшительный суффикс -ак (Чернак) + литовский суффикс -auskas. Такая конструкция — редкий пример гибридной фамилии, где славянское прозвище получило литовское оформление. Носители фамилии — потомки тех, кто либо носил прозвище Чернак, либо происходил из деревни Чернаки, а затем обосновался в Литве и принял местную форму фамилии.