Фамилия Кернакевикиус (в латинском написании Cernakevicius) — это редкий пример фамилии, которая прошла через несколько языковых фильтров, прежде чем закрепиться в современном виде. Её основа, скорее всего, уходит корнями в восточнославянское прозвище Чернак. Такое прозвище в старину давали человеку со смуглой кожей или чёрными волосами, либо тому, кто постоянно носил тёмную одежду. В более широком смысле «чёрный» могло означать «злой», «недобрый», а в социальном контексте — «платящий подати», то есть не освобождённый от повинностей (в отличие от «белый», «обеленный» — свободный от налогов).

Однако есть и вторая версия, не менее правдоподобная: фамилия могла произойти от топонима Чернаки. Деревня с таким названием существует в Брестской области Белоруссии. Если предок носителя фамилии был выходцем оттуда, то его могли прозвать «чернаковским», а затем и «Чернакевичем» — по месту, откуда он пришёл.

Ключевая особенность этой фамилии — её путь через разные языки. Первоначальная форма, скорее всего, звучала как Чернакевич (с суффиксом -евич, указывающим на происхождение от отца или на принадлежность к роду Чернака). Такая модель типична для Белоруссии и Польши. Затем, в результате миграции или смены административных границ, фамилия попала в литовскую среду, где приобрела характерное окончание -икиус (литовская маскулинизация). Так из белорусского «Чернакевич» получился литовский «Кернакевикиус».

Именно сочетание славянской основы (-чернак-) и литовского окончания (-икиус) делает эту фамилию уникальной. Она свидетельствует о том, что её носители жили на стыке культур, в регионе, где веками переплетались славянские и балтийские языки.