Фамилия Хадыходжаева — редкий случай, когда географию носителей можно определить почти безошибочно, даже не заглядывая в статистику. Её основа — арабское имя Ходжа (или Ходжа), которое в тюркском и иранском мире означает «господин», «хозяин», «наставник» или «потомок пророка Мухаммеда» (в последнем значении — сейид). Первая часть, Хады, — это арабское имя, означающее «направляющий», «ведущий правильным путём» (одно из имён Аллаха). Сложение двух имён — Хады и Ходжа — даёт составное имя Хадыходжа, которое затем оформилось в фамилию с помощью типичного для Средней Азии суффикса принадлежности -ев/-ева.

Словообразовательная модель здесь не русская, а региональная. Суффикс -ев в фамилиях тюркского и иранского происхождения часто выполняет ту же роль, что и в русских фамилиях — указывает на принадлежность к роду. Но в отличие от русских -ов/-ев, которые крепятся к прозвищам или профессиям, в этом случае суффикс добавили к уже готовому личному имени, а не к нарицательному слову. Фамилия Хадыходжаева — это буквально «из рода Хадыходжи».

Этимологически имя Хадыходжа можно разобрать как «направляющий господин» или «праведный наставник». Социальный контекст здесь важен: носители такой фамилии, скорее всего, происходят из семьи, где предок был уважаемым религиозным деятелем, учителем или человеком, ведущим род от пророка. В дореволюционной Средней Азии ходжи составляли особую прослойку — не столько духовенство, сколько наследственную знать, которая не платила налогов и имела право на землю. Поэтому фамилия Хадыходжаева — не просто указание на имя, а маркер сословного статуса предков.

Географически фамилия почти наверняка уводит в Узбекистан или Таджикистан. В русском языке она сохранила арабскую графику (буква «х» в начале, а не «к» или «г») и окончание -ева, которое закрепилось в советских паспортах для женского рода. Мужской вариант — Хадыходжаев. Встречается фамилия редко, в основном в Самаркандской, Бухарской и Ташкентской областях. По сравнению с более частыми Ходжаевыми или Хасановыми, вариант Хадыходжаева — более точный, так как сохраняет полное имя предка, а не только его титул.