Фамилия Хаглышева — редкий случай, когда корень слова почти наверняка не славянский, а тюркский. Основа «хаглы» или «хаклы» восходит к тюркским языкам, где слово «хак» (или «хакк») означает «право», «истина», «справедливость». Соответственно, «хаклы» — это «правый», «справедливый», «имеющий право». Такое прозвище могли дать честному, уважаемому человеку, судье или тому, кто отстаивал правду в споре. Встречается также вариант, где «хаглы» связано с тюркским «ага» — «господин», «старший», но версия с «правдой» лингвистически надёжнее.

Модель образования фамилии — классическая для русского языка: к тюркской основе добавили русский суффикс принадлежности -ев (в женском роде -ева). Суффикс указывает на то, что фамилия образована от прозвища отца: Хаглыш (или Хаглышев) — сын Хаглыша. Форма Хаглышева — это женский вариант, то есть «жена или дочь Хаглышева». Мужской вариант фамилии — Хаглышев.

География бытования фамилии узкая. По данным открытых источников и телефонных справочников, носители фамилии Хаглышевы встречаются в основном в Поволжье, особенно в Самарской и Ульяновской областях, а также в Татарстане. Это косвенно подтверждает тюркское происхождение: в этих регионах исторически жили татары, башкиры, чуваши, и русские фамилии на тюркской основе здесь не редкость.

Скорее всего, предок носителя фамилии был крещёным татарином или башкиром, либо русским, получившим прозвище от соседей-тюрков. В любом случае, фамилия Хаглышева — живое свидетельство многовекового соседства и смешения культур на Волге.