Фамилия Халайцан — одна из тех, что сразу обращает на себя внимание нехарактерным для русского языка окончанием. Это верный признак того, что её корни лежат за пределами собственно русской ономастики, а точнее — в молдавской или румынской среде. Основа фамилии — слово «халай», которое в молдавском и румынском языках имеет два значения: «хвала» или «похвала» и, в переносном смысле, «хвастун» или «бахвал». Суффикс «-цан» (или румынское «-cean») указывает на принадлежность к местности или на происхождение от определённого рода. В данном случае носитель фамилии Халайцан — это, скорее всего, «потомок того, кого прозвали Халай», то есть человек, получивший прозвище от слова «халай».

Вероятнее всего, фамилия образовалась от прозвища, данного человеку за его характер. Если «халай» понимать как «хвала», то прозвище могли дать либо слишком хвастливому, либо, наоборот, тому, кого часто хвалили, — например, умелому мастеру или удачливому воину. Второе значение — «хвастун» — более распространено в бытовой речи, и именно оно чаще становилось основой для прозвища, которое затем закреплялось как фамилия. Таким образом, первый носитель фамилии Халайцан мог быть человеком, склонным к похвальбе, или же, если следовать более мягкой версии, просто обладал весёлым и открытым нравом.

С географической точки зрения фамилия Халайцан почти наверняка происходит из исторической области Бессарабия (современная Молдова и прилегающие районы Украины). Суффикс «-цан» характерен для молдавских фамилий, образованных от прозвищ или имён: ср. с фамилиями Бурдужан, Кожокарь, Караман. В русском языке такие фамилии приживались в результате миграций молдавского населения на юг Российской империи, особенно в XIX веке. Поэтому встретить Халайцана можно не только в Молдове, но и на юге Украины, в Одесской области, а также в среде потомков переселенцев в других регионах.

В отличие от большинства русских фамилий, которые заканчиваются на «-ов», «-ев» или «-ин», фамилия Халайцан сохранила свою исходную форму без адаптации. Это говорит о том, что она вошла в русский обиход относительно поздно и не подверглась русификации. В документах XIX — начала XX века могли встречаться варианты написания: Халайцан, Халайцану, а также искажённое Халайчан. Однако современная норма закрепилась именно в форме Халайцан.

Сословная принадлежность носителей этой фамилии, скорее всего, была крестьянской или мещанской. Молдавские крестьяне, получавшие фамилии по прозвищам, нередко носили именно такие — ёмкие, но не указывающие на знатное происхождение. Дворянских родов с фамилией Халайцан в российских родословных книгах не зафиксировано. Таким образом, фамилия Халайцан — яркий пример того, как прозвище, данное за характерную черту, перешло в фамилию и сохранило память о своём носителе, жившем, вероятно, в молдавском селе два-три столетия назад.