Фамилия Халимеева — редкий случай, когда мы почти наверняка можем определить её происхождение, но с оговоркой: оно не славянское. В основе фамилии лежит личное имя Халим. Это арабское имя, означающее «кроткий», «мягкий», «терпеливый». В исламской традиции аль-Халим — один из эпитетов Аллаха, «Снисходительный». Имя было распространено у народов, исповедующих ислам, — у татар, башкир, народов Кавказа, а также в Средней Азии.

Фамилия образована по русской модели: к основе Халим (или его варианту Халиме) добавлен женский суффикс -ева. Суффикс -ев (а не -ов) появляется, когда основа заканчивается на мягкий согласный или на -й. В данном случае он приставлен к форме Халиме — либо к женскому имени, либо, что чаще, к диалектному произношению мужского имени Халим, где конечный звук смягчился. Фактически, Халимеева — это «дочь (или жена) человека по имени Халим».

Форма на -ева, а не на -ин, указывает на то, что фамилия сложилась в среде, где русская патронимическая модель была усвоена, но имя-основа не было исконно русским. Обратите внимание: фамилия Халимеева почти всегда женская. Мужской вариант — Халимеев. Встречается она преимущественно в Поволжье, на Урале и в Западной Сибири — в регионах с давними татарскими и башкирскими общинами.

Есть и менее вероятная, но возможная версия: связь с тюркским словом «халык» (народ) или «калым» (выкуп за невесту), но она разбивается о простое правило — в фамилии чётко читается имя Халим, а не эти корни. Так что, скорее всего, первый носитель фамилии был сыном или дочерью уважаемого в общине человека по имени Халим, и русские писцы записали его по привычной схеме.