Фамилия Хамикаева образована от мусульманского имени Хамикай, которое образовано от арабской именной основы Хами, что значит «защитник». Элемент -кай представляет собой тюркский ласкательный суффикс, который часто встречается в составе восточных имён. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Хамикаевых можно лишь на основании генеалогических исследований.