Фамилия Ханбатыров — редкий пример, где русская модель образования (суффикс -ов) накладывается на сложносоставное имя восточного происхождения. В основе лежит тюркское или монгольское двусоставное слово: «хан» (владыка, правитель, князь) и «батыр» (богатырь, герой, воин). Вместе «Ханбатыр» означает «богатырь-хан» или «хан-герой» — титул или прозвище, которое давали военачальнику, отличавшемуся личной доблестью, либо эпическому персонажу. В казахском, татарском, башкирском и других тюркских языках «батыр» — устойчивая часть имён (например, Ахмет-батыр, Ислам-батыр), а «хан» в составе личного имени указывало на знатное происхождение или высокий статус.

Географически фамилия тяготеет к регионам с тюркским населением: Казахстан, Башкортостан, Татарстан. В русских документах она закрепилась в XIX — начале XX века, когда при переписях и воинском учёте тюркские имена русифицировали, добавляя окончание -ов. Суффикс -ов здесь стандартный патронимический (чей сын?), то есть Ханбатыров — буквально «сын Ханбатыра». Важно, что фамилия не указывает на прямое родство с ханом: в народной среде «ханом» могли прозвать зажиточного или властного человека, а «батыром» — силача или удачливого воина.

Встречаются варианты написания: Ханбатыров и Ханбатиров (под влиянием произношения). Родственные фамилии — Батыров, Ханбеков, Хангильдеев — построены по той же схеме: «хан» + другое тюркское слово. Фамилия Ханбатыров — одна из немногих, где в основе соединились сразу два титула, что делает её почти «двойным» именем-пожеланием: предка видели как правителя и героя одновременно. Сословно носители чаще всего были из крестьян или казаков (в Оренбургском и Уральском казачьих войсках встречались тюркские имена в документах), реже — из мелкопоместной знати.