Фамилия Харисановы — редкий случай, когда фамилия образована не напрямую от крестильного имени, а от его разговорной производной формы, причём с неочевидным суффиксом. Основа здесь — имя Харисан, которое в русской традиции звучало как Хариса́н (ударение на последний слог). Это народная, упрощённая форма церковного имени Харисим (или Харисин), которое, в свою очередь, восходит к греческому χαρίεις — «прелестный», «миловидный». В святцах имя встречалось редко, поэтому и фамилия не получила широкого распространения.

Модель образования — патроним на -ов: Харисанов буквально означает «сын Харисана». Интересно, что суффикс -ан в основе (Харис-ан) в русских именах выполнял две функции: либо уменьшительно-ласкательную (как Иван → Ваня), либо «огрубляющую», просторечную (как Степан → Степаха). В случае с Харисаном скорее второй вариант — имя сократили до удобного для бытового произношения, отбросив греческое окончание.

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и Уралу. В дореволюционных метрических книгах Харисановы чаще всего фиксировались в Казанской, Вятской и Пермской губерниях — в среде крестьян и мещан, где церковные имена переделывали на свой лад. Это не дворянская и не купеческая фамилия: её носители, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами, реже — мастеровыми на заводах.

С точки зрения словообразования фамилия примечательна тем, что сохранила архаичную форму с двойным «а»: Харис-анов, а не Харисонов (как было бы, если бы имя воспринимали как Хариса на греческий манер). Это подтверждает, что имя бытовало именно в народной, а не книжной среде. Однокоренных фамилий мало: Харисимов, Харисинов — они ещё реже и почти исчезли. Харисановы же устоялись благодаря тому, что основа звучала привычно для русского уха (ср. Анисим → Анисанов).