Фамилия Харкибенова — редкий случай, когда в основе лежит не имя или профессия, а целое составное прозвище, да ещё и с женским суффиксом. Сразу бросается в глаза необычная конструкция: она образована от мужской формы Харкибенов, а та, в свою очередь, от прозвища Харкибен. Фамилия явно не славянская по корню, и её разбор требует обращения к тюркским языкам.

Ключевой элемент — «Харки». Скорее всего, это искажённое тюркское «харкы» или «харки», что в разных диалектах означает «крик», «шум», «ссора» или даже «крикун». Вторая часть — «бен» — это типичный для тюркских языков суффикс, образующий прилагательные или существительные со значением «обладающий чем-то», «сделанный из чего-то». Таким образом, прозвище Харкибен могло означать «тот, кто с криком» или «крикливый». В народе так могли прозвать человека шумного, сварливого или, наоборот, громкоголосого, например, глашатая или зазывалу на базаре.

Фамилия несёт на себе отпечаток региональной культуры. Суффикс «-ов» указывает на то, что фамилия русифицировалась, то есть её носители жили в среде, где русский язык был официальным, но тюркские корни остались. Такие фамилии характерны для народов Поволжья (татары, башкиры), Северного Кавказа (кумыки, ногайцы) или для казачества, впитавшего тюркские прозвища. Встречается она в основном на юге России и в Закавказье, где сохранились очаги тюркской ономастики.

Интересно, что в написании фамилии могла произойти замена звуков: изначальное «харкы» со временем превратилось в «харки» под влиянием русской фонетики. Однокоренные фамилии — Харкиев, Харкинов, Харкеев — встречаются у тюркских народов, но Харкибенова стоит особняком из-за своей двухчастной основы. Это не фамилия знатного рода, а скорее меткое уличное прозвище, которое закрепилось за семьёй из-за особенности характера предка.