Фамилия Хармсоне — один из тех случаев, когда внешне «русская» форма суффикса скрывает иноязычную основу. На первый взгляд, окончание «-е» наводит на мысль о прибалтийском или польском следе, но здесь всё сложнее.

Скорее всего, перед нами русифицированная версия немецкой или еврейской (ашкеназской) фамилии Хармсон. В таком случае основа — личное имя Харм, которое является краткой формой от Хармут (Harmut) или, реже, от библейского имени Хирам. Суффикс «-сон» в германских языках означает «сын»: Хармсон буквально — «сын Харма». В Российской империи, особенно в Прибалтике и на юго-западе, такие фамилии нередко адаптировали к местной грамматике, добавляя окончание «-е» (по аналогии с польскими фамилиями на -е). Получалось Хармсоне — как вариант записи, фиксирующий принадлежность к роду.

Второй путь, менее вероятный, но возможный для южных регионов: фамилия могла возникнуть из прозвища, связанного с диалектным словом «хармс» (нечто вредное, злое, от «харм» — вред). В этом случае суффикс «-оне» — редкий, почти единичный для русских фамилий, и мог появиться под влиянием молдавской или украинской антропонимики, где такие окончания встречаются чаще. Однако эта версия держится на шаткой основе: в словарях русских прозвищ слово «хармс» не зафиксировано.

Географически фамилия Хармсоне — редкость. Её носители встречаются в основном на северо-западе России (Ленинградская область, Карелия) и в Прибалтике, что подтверждает версию о немецко-балтийском происхождении. В дореволюционных метриках эта фамилия могла писаться по-разному: Хармсон, Хармзоне, Хармсонов — в зависимости от языка документа и грамотности писаря.

Социальный контекст прост: предки носителя фамилии, скорее всего, были ремесленниками, мещанами или мелкими торговцами из числа остзейских немцев или евреев, перешедших в православие. Дворянских родов с такой фамилией не известно. В советское время фамилия почти исчезла из-за миграций и ассимиляции, поэтому сегодня каждый её носитель — обладатель действительно редкого родового имени.