Фамилия Хавайдарова — редкий случай в русском ономастиконе, где тюркская основа сочетается с русским патронимическим суффиксом. Корень «хавай» почти наверняка восходит к арабскому «хава» (воздух, атмосфера), которое через персидское и тюркское посредство вошло в языки народов Кавказа и Средней Азии. Вторая часть «-дар» (персидское «даштэн» — иметь, владеть) образует сложные слова со значением «обладатель»: «хавайдар» — буквально «владеющий воздухом», то есть свободный, вольный человек. В тюркских языках это слово могло быть прозвищем независимого, гордого человека или даже метафорой суфийского мистика, «дышащего божественным духом».

Модель образования фамилии — Хавайдарова — типична для русификации восточных фамилий в XIX–XX веках. Суффикс -ов/-ева присоединялся к фамилиям на -дар, -хан, -бек при записи в метрические книги или советские паспорта. При этом ударение в исходной форме, скорее всего, падает на последний слог (Хавайда́р), а в русском варианте сместилось на предпоследний — Хавайда́рова.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где смешивались татарское, башкирское и кавказское влияние: встречается в Татарстане, Башкортостане, а также среди кумыков и ногайцев. Встречается и вариант Хавайдаров — без женского окончания, что не меняет сути. В русской среде фамилия часто воспринимается на слух как «экзотическая», но её семантика проста и красива: предок носителя был человеком, которого называли «свободным как ветер».

С точки зрения сословной истории, Хавайдаровы вряд ли принадлежали к высшей аристократии: прозвища с корнем «хава» обычно давали не бекам и мурзам, а ремесленникам, торговцам или духовным лицам низшего ранга. Однако точных архивных данных о распространении фамилии в дворянских родословных книгах нет — она остаётся преимущественно крестьянской и мещанской.