Фамилия Хавшаков — редкий пример, где географический корень почти наверняка перевешивает антропонимический. Скорее всего, перед нами не прозвище по черте характера или занятию, а указание на выходца с определённой территории. Основа «Хавшак» или «Хавша» прослеживается в топонимике Северного Кавказа и Закавказья. В осетинском языке есть слово «хæфс» (лягушка), но связь с фамилией сомнительна. Куда логичнее предположить, что в основе лежит грузинский или сванский топоним вроде Хавши или Хавша, а суффикс «-ак» — уменьшительная или уничижительная форма, характерная для тюркских и кавказских языков. В таком случае Хавшаков — это «тот, кто из Хавши», или «маленький Хавша».

Модель образования фамилии — патроним на «-ов» от прозвища или имени Хавшак. Но, в отличие от типичных русских фамилий на «-ов», где суффикс крепится к крестильному имени (Иван — Иванов), здесь основа явно не славянская. Это типичная ситуация для фамилий, возникших на стыке культур: русский патронимический суффикс наложился на местную, кавказскую основу. Такие фамилии часто встречаются среди казачества, которое активно контактировало с горскими народами, или среди переселенцев, получивших фамилию по месту прежнего жительства.

Есть и альтернативная, хотя и менее вероятная, версия — связь с арабским именем Хафиз (хранитель, знающий Коран наизусть). В тюркской среде это имя могло трансформироваться в Хавша или Хавшак. Но для такой версии не хватает промежуточных звеньев — известных форм вроде Хафшаков или Хавшиев, которые встречаются чаще. Поэтому топонимическая гипотеза выглядит предпочтительнее: она объясняет редкость фамилии и её привязку к конкретному региону.

Сословная принадлежность первых Хавшаковых неясна. Фамилия не встречается в дворянских родословных книгах Российской империи, что косвенно указывает на крестьянское, мещанское или казачье происхождение. В современных телефонных справочниках и базах данных Хавшаковы встречаются точечно — в Ставропольском крае, Ростовской области и в Москве, что подтверждает южную, кавказскую траекторию миграции.