Фамилия Хавунка — редкая и нестандартная для русского уха по двум причинам: окончание -ка вместо привычных -ов/-ин и корень, которого нет в словарях распространённых русских имён. Чтобы понять её происхождение, придётся отбросить шаблон «отчество от крестильного имени» — здесь работает прозвищная модель.

Основа «Хавун» — это, скорее всего, прозвище, образованное от украинского или белорусского глагола «хаваць» — прятать, скрывать, хоронить. В юго-западных говорах «хавун» могло означать человека скрытного, запасливого, который что-то припрятывает, либо того, кто работает с погребением (например, могильщик или сторож на кладбище). Менее вероятно, но возможно, что в основе лежит тюркское «хавун» (дыня) — тогда прозвище получил любитель бахчевых или торговец ими, но для славянской территории это экзотика.

Суффикс -ка в фамилиях — явление нерусское, но типичное для украинской и белорусской ономастики. В этих языках фамилии на -ко, -ка, -енко массово вытесняли патронимы. Хавунка — это не «сын Хавуна» (как было бы с суффиксом -енко), а скорее «тот, кто относится к Хавучу» или просто прозвище, застывшее в уменьшительной форме. Такие фамилии часто фиксировались в казачьей среде и среди крестьян Правобережной Украины.

Географически фамилия Хавунка должна быть привязана к западу Украины или югу Беларуси — там, где глагол «хаваць» — живая лексика, а не архаизм. В России она почти не встречается, в документах XIX века её носители могли записываться как Хавунко или Хавункин, пока писарь не привыкал к местному произношению.

Если предположить, что прозвище Хавун давалось не по черте характера, а по занятию, то речь идёт о человеке, который «ховал» — прятал или хранил что-то чужое (например, контрабанду, товар, тайник). В условиях пограничья или торговых местечек такое занятие было распространённым и давало прозвище, переходившее в фамилию.

Коротко: Хавунка — украинская или белорусская фамилия от прозвища «хавун» (скрытный, прячущий), оформленная уменьшительным суффиксом -ка. Предки — скорее всего, крестьяне или мещане западных губерний, чьё прозвище закрепилось за родом.