Фамилия Хайнацький звучит необычно для русского уха, и это не случайно. Её основа и модель образования указывают на польское или западноукраинское происхождение. Фамилия образована по типичной для этих регионов модели с суффиксом -цк- (-ский/-цький). Это так называемый «географический» суффикс, который чаще всего присоединяли к названиям населённых пунктов, чтобы указать, откуда родом человек.

Корень фамилии — «Хайна». Скорее всего, он восходит к названию населённого пункта. В Польше есть несколько мест с похожим названием, например, село Хайна (Hajna) или Хайнув (Hajnów). Также возможна связь с немецким словом «Hain» (роща, лесок), что в польском языке могло трансформироваться в «haj» или «hajna». Таким образом, Хайнацький — это человек, происходящий из места под названием Хайна, Хайнув или из местности, связанной с лесом.

Другая, менее вероятная, версия выводит основу от личного имени. В старой польской традиции существовало имя Хайно (Hajno), которое могло быть народной формой имени Иоанн (Ян). В таком случае фамилия Хайнацький могла означать «потомок Хайны» или «сын Хайны», но модель с суффиксом -цкий всё же сильнее тяготеет к географическому значению.

Встречаются варианты написания: Хайнацкий, Хайнацький, а также польская форма Hajnacki. Поскольку фамилия редкая, её носители могли быть как шляхтой (мелкой земельной знатью, бравшей фамилию по своему поместью), так и простыми крестьянами, которых записывали по названию родной деревни. Сословную принадлежность предков без генеалогического исследования установить трудно, но ясно одно: корни этой фамилии лежат на польско-украинском пограничье, где смешивались языки и культуры.