Предположительно, оно ведет свое начало от немецкого нарицательного Helm – «шлем». Исходя из этого, можно предположить, что прозвище Хельмер относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на род деятельности основателя фамилии: он мог заниматься изготовлением воинских доспехов. Согласно другой гипотезе, фамилия Хельмер восходит к названию города а Литве – Кельме. В таком случае предок Хельмер мог быть выходцем из этого населенного пункта. Например, только у евреев можно было встретить такие фамилии, как Вейценбаум, что в переводе с немецкого означало «пшеничное дерево», Зауэрштром – «кислый поток», Левенфиш – «рыба-лев», Цигенбаум – «козье дерево», Квечман – «высказываться неохотно». Известным представителем фамилии является Хельмер Юлиус Хансен (1870-1956) — известный норвежский путешественник и исследователь, участник двух экспедиций Амундсена к Южному полюсу и Северо-Западному проходу.