Фамилия Хипыбэиы — один из тех редких случаев, когда написание почти полностью выдаёт происхождение. Перед нами не русская и не славянская фамилия в привычном словообразовательном смысле. В ней нет ни одного из типичных русских фамильных суффиксов (-ов, -ев, -ин, -ский, -их, -ых). Окончание «-ы» в русском языке обычно характерно для фамилий в форме родительного или множественного числа (типа Черных, Косых), но основа «Хипыбэи» на славянский корень не похожа — в ней нет привычных корней, связанных с ремеслом, внешностью или именем.

Скорее всего, фамилия Хипыбэиы — это русифицированная запись фамилии народа коми или другого финно-угорского населения северо-востока Европейской России. В языках коми-зырян и коми-пермяков распространены окончания «-ы» (как показатель множественного числа или притяжательности). Основа «Хипыбэи» может быть сложной: первая часть «Хип-» (или «Кып-» при искажении записи) нередко восходит к коми слову «кып» — «горб», «выпуклость», либо к личному имени Хипа (уменьшительное от христианских имён вроде Ипполит, адаптированных местным населением). Вторая часть «-бэи» — вероятно, искажённое коми «бӧж» (хвост) или «бӧр» (задний, тыл). Таким образом, в основе могло лежать прозвище, описывающее человека с заметной особенностью осанки или походки.

Географически фамилия с таким набором звуков и окончанием тяготеет к Республике Коми, Пермскому краю или Кировской области. В официальных документах XIX — начала XX века русские писаря часто записывали нерусские фамилии на слух, не соблюдая точной фонетики, поэтому «Хипыбэиы» могло возникнуть как вариант фамилии Хипыбӧжы (с мягким знаком на конце) или Хипыбӧев. При переписи такое написание могло закрепиться за одной семьёй, а соседи с той же основой получили более привычное русское окончание «-ов».

Социальный статус первых носителей, скорее всего, был крестьянским или охотничьим. В коми среде фамилии часто образовывались от уличных прозвищ, данных по занятию, внешности или месту жительства. Никаких свидетельств о дворянском происхождении или принадлежности к купечеству у этой фамилии нет — это фамилия простого сельского населения, сохранившая архаичную региональную форму.