Фамилия Хитюнин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Если отбросить маловероятные версии (например, связь с украинским «хитюк» в значении «хитрец»), то наиболее логичное объяснение даёт анализ суффикса и диалектной лексики.

Фамилия образована по самой распространённой русской модели: основа + суффикс -ин. Суффикс указывает на принадлежность: Хитюня — это человек, а Хитюнин — «сын Хитюни» или «человек из семьи Хитюни». Значит, ключ к разгадке — в личном имени или прозвище Хитюня.

В севернорусских и сибирских говорах слово «хить» означало «хижина», «шалаш», «временное жильё», а также «загон для скота». Отсюда прозвище Хитюня могли дать человеку, который жил в бедной избе, строил шалаши или пас скот в загоне. Есть и другая, более прозаичная версия: в некоторых диалектах «хитюня» — это тот, кто постоянно суетится, хлопочет по хозяйству, «хитится» (то есть старается, хлопочет). Таким образом, прозвище могло характеризовать хозяина, вечно занятого по дому.

Словообразовательная модель с суффиксом -юня (как Васюня от Василий, Костюня от Константин) характерна для ласкательных или уменьшительных форм имён. Однако в случае с Хитюней мы, скорее всего, имеем дело не с крестильным именем (церковных имён на «Хит-» нет), а с прозвищным именем, которое в быту могло заменить официальное. Фамилия Хитюнин — яркий пример того, как за неброской основой стоит конкретная бытовая деталь из жизни предка: его жильё, род занятий или даже манера поведения. География фамилии, судя по редким встречаемости, может быть привязана к северным или центральным областям России, где были распространены соответствующие говоры.