Фамилия Хоецян — армянская по происхождению, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса, который сразу выдаёт этническую принадлежность. Окончание -ян (в старой орфографии -янц) — один из самых распространённых армянских патронимических суффиксов, означающий «принадлежащий к роду» или «потомок кого-либо». В русской традиции такие фамилии обычно не склоняются, и Хоецян здесь не исключение.

Основа фамилии — Хоец. Это, скорее всего, вариант армянского имени или прозвища Хоян, Хоянц, которое в свою очередь восходит к слову «хой» — в некоторых диалектах армянского языка так называли пастуха или сторожа. Есть и другая версия: «хой» могло быть формой тюркского имени, заимствованного в армянскую среду, но она менее обоснована, так как типичная армянская модель словообразования с суффиксом -ец (как в фамилии Хоецян) указывает на местное происхождение из конкретного села или рода.

Таким образом, Хоецян — это «потомок Хоеца», то есть человека, которого прозвали за занятие пастушеством или, возможно, за место жительства. В армянской ономастике фамилии на -ян редко дают точную географическую привязку, но по косвенным данным носители фамилии Хоецян исторически концентрировались в западных областях исторической Армении, в частности в районе Вана и Эрзрума, откуда после геноцида 1915 года многие переселились в Восточную Армению и диаспору.

В написании фамилии встречается вариант Хоянц — с более архаичным суффиксом, который в русской передаче часто упрощается до -ян. Сравните с однокоренными фамилиями Хоян, Хоянян — они образованы от той же основы, но с другим суффиксальным оформлением. Социальный статус предков Хоецян, судя по прозвищу, был простым — пастухи или крестьяне, без связи с дворянскими или княжескими родами.