Фамилия Холохоренко — яркий пример украинской модели фамилеобразования с суффиксом -енко, который в XVI–XVIII веках массово присоединяли к прозвищам и именам, обозначая потомка или носителя признака («чей-то сын»). Основа здесь — Холохор, прозвище, которое само по себе звучит как сложное слово и требует разбора.

Корень «Холохор» не имеет однозначного толкования, но наиболее вероятная версия связывает его с украинским диалектным «холох» — шум, гам, беспорядок, или с «холоти» — трясти, болтать. Второй компонент («хор») может быть либо искажением «кор» (от «корити» — бранить, корить), либо частью звукоподражательного оборота. В сумме прозвище Холохор могло означать человека суетливого, крикливого, склонного к ссорам — «шумливого забияку». В украинской антропонимии такие «характеристические» прозвища (Гримайло, Стукало, Бурко) были обычны и не несли резко негативного оттенка, скорее фиксировали заметную черту.

Менее правдоподобна версия о связи с тюркскими корнями (например, «холо» — раб, слуга), так как суффикс -енко и фонетика слова указывают на восточнославянскую, а не степную среду бытования. Фамилия Холохоренко почти наверняка сформировалась на территории Левобережной или Слободской Украины (современные Черниговская, Полтавская, Сумская области), где модель на -енко была доминирующей среди казачества и крестьянства.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто закрепляли за родом по отцу с официальным именем, Холохоренко сохранило в основе именно уличное прозвище, что говорит о неформальной среде возникновения — скорее всего, в казацкой или сельской общине. Носители фамилии не принадлежали к высшим сословиям: в реестрах Гетманщины XVIII века подобные фамилии встречаются среди рядовых казаков и посполитых.

Интересно, что фамилия не получила широкого распространения за пределами Украины и осталась локальной, что делает её своеобразным маркером происхождения из определённого региона. Встречаются варианты написания с одной «о» (Холохоренко), но это скорее результат упрощения при записи, чем отдельная ветвь.