Фамилия Хонимкулов — редкий пример фамилии, образованной от женского имени. Основа «Хоним» восходит к тюркскому слову «ханум» (госпожа, знатная женщина), которое в Средней Азии и Поволжье стало личным именем. Суффикс «-кулов» указывает на патронимическую модель, характерную для узбекской, таджикской и каракалпакской традиции: буквально «сын Хонимкула». В этой конструкции «кул» (раб, слуга) в составе сложного имени выполняет роль компонента со значением «раб Божий» или «слуга», как в именах Худайкул, Аллакул. Таким образом, Хонимкул — составное имя, где «Хоним» (женское имя) соединено с мужским формантом «кул», что необычно: чаще женские имена не становились частью отчества. Вероятно, исходным было прозвище или имя матери, которое впоследствии закрепилось за родом.

Географически фамилия встречается почти исключительно в Узбекистане, особенно в Хорезмской области и Каракалпакстане. В России и других странах СНГ её носители — потомки переселенцев из Средней Азии. Варианты написания: Хонимкулов, Ханимкулов, Ханумкулов — разница в передаче гласной «а/о» связана с диалектными особенностями (в узбекском языке «ханум» может звучать как «хоним»).

С точки зрения словообразования, фамилия уникальна тем, что в основе лежит женское имя, но с мужским патронимическим суффиксом. Это противоречие объясняется тем, что в дореволюционной Средней Азии фамилии часто давались не по отцу, а по матери — если она была известна или занимала высокое положение (например, дочь богатого купца или духовного лица). Вторая версия: «Хоним» могло быть не именем, а прозвищем уважаемой женщины, и внуки получили фамилию по ней.

Социальный контекст: фамилия не дворянская и не крестьянская — она отражает скорее городскую или ремесленную среду, где ценились родственные связи по материнской линии. В советское время написание закрепилось через паспортные столы, но в устной речи сохранились старые варианты.