Фамилия Хонхолджинова — редкий случай, когда бурятское происхождение можно определить почти без оговорок. Основа фамилии — «хонхолджин», что в переводе с бурятского означает «колокольчик» или «бубенчик». Скорее всего, это прозвище человека, который либо носил звонкую одежду, либо обладал звонким, громким голосом, либо же занимался изготовлением или продажей колокольчиков. В бурятской традиции такие прозвища нередко давали за характерную внешнюю или внутреннюю черту.

Модель образования типична для бурятских фамилий, русифицированных в XIX–XX веках. К основе «Хонхолджин» добавили русский суффикс -ов-, а затем стандартное окончание -а, указывающее на женский род. Мужской вариант — Хонхолджинов. Суффикс -ов здесь не столько патронимический (как в русских фамилиях сына), сколько адаптирующий: так бурятские родовые имена вписывали в российскую паспортную систему. В самой Бурятии фамилия встречается нечасто, что делает её ещё более локальной — возможно, она привязана к конкретному роду или улусу.

Если копнуть глубже, «хонхолджин» может быть не просто прозвищем, а остатком древнего тотемического или шаманского имени. Колокольчик в бурятской культуре — не только музыкальный инструмент, но и атрибут шаманов, использовавшийся в обрядах для призывания духов. Поэтому предок-носитель такого имени мог быть человеком, связанным с сакральными практиками, либо просто потомком того, кто первым получил прозвище за любовь к звону. В любом случае, фамилия Хонхолджинова — это не случайный набор звуков, а метка, ведущая в буддийскую и кочевую степную среду.