Фамилия Хратионов — редкая и с точки зрения словообразования прозрачная, и с точки зрения корня — загадочная. На первый взгляд она укладывается в стандартную модель: основа на твёрдый согласный плюс суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Хратиона). Но проблема в том, что канонического имени «Хратион» в святцах нет, а значит, перед нами либо адаптация греческого имени, либо переосмысление прозвища.

Наиболее правдоподобная версия отсылает к греческому имени Харалампий (Χαράλαμπος — «сияющий радостью»). В просторечии оно давало множество сокращённых форм: Харлам, Хралам, Храл, а затем и Хратя, Хратик, Хратион. Уменьшительное «Хратион» могло возникнуть по той же модели, что «Гаврила» от Гавриила или «Михей» от Михаила. Суффикс -он в таких формах нередко встречается в южнорусских и украинских говорах, где имя «Хратион» могло бытовать как самостоятельное крестьянское прозвище-имя. Со временем его зафиксировала фамилия: сын Хратиона стал Хратионовым.

Менее вероятна, но не исключена версия, что в основе лежит прозвище Хратый от диалектного глагола «хратить» — в некоторых говорах это значило «беречь, хранить, прятать». В таком случае Хратион — это «хранитель, бережливый человек», а фамилия — отчество от этого прозвища. Однако эта версия слабее: глагол редкий, а форма с суффиксом -ион скорее указывает на имя, чем на прямое прозвище.

Географически фамилия Хратионов встречается точечно, в основном в центральных и южных областях России, а также среди потомков переселенцев на Урал. В дореволюционных метрических книгах она почти не фиксируется — это говорит о её позднем оформлении или малой численности рода. Сословно носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами: дворянские фамилии с таким неканоническим корнем почти не встречаются.

Деталь, которая выделяет эту фамилию среди похожих: двойной суффикс -ион-ов. Обычно фамилии от имён на -а (Хратя, Гавря) дают форму Хратин или Хратьев, но Хратионов сохранил полную уменьшительную основу, как, например, фамилия Артамонов от имени Артамон. Это редкий случай, когда прозвище-имя на -он закрепилось в паспортной форме целиком, не редуцировавшись.