Фамилия Хрепренин — редкая, и её происхождение неочевидно. Чтобы понять, откуда она взялась, нужно разобрать её по косточкам. Основа фамилии — «Хрепрени-», к которой добавлен типичный русский суффикс принадлежности «-ин». Суффикс «-ин» указывает на то, что фамилия образована от существительного или прозвища, оканчивающегося на -а или -я (например, «Хрепреня»). То есть предка могли звать Хрепреней, и это прозвище перешло на его потомков как фамилия.

Самая вероятная версия связывает основу «хрепр-» с диалектным словом «хреп» или «хребет». В русских говорах «хреп» означало спину, хребет, а также могло относиться к возвышенности, гряде. Прозвище Хрепреня могли дать человеку с широкой, крепкой спиной, сутулому или, наоборот, тому, кто жил на холме. Суффикс «-ен-» в основе — уменьшительный или усилительный, он мог придавать прозвищу оттенок «крепкий, коренастый» (как «хрепень» — нечто массивное). Менее вероятно, но возможно, что в основе лежит искажённое «хрящ» или «хрест» (крест), но фонетически это менее убедительно.

В ономастических работах, например в словаре Б. Унбегауна, подобные фамилии с основой «хреп-» не выделены в отдельную группу, но они встречаются в северных и центральных регионах России. Фамилия Хрепренин могла возникнуть в среде крестьян или посадских людей, где прозвища по внешним признакам были обычным делом. Написание с «е» после «р» (а не «ё») говорит о том, что в основе мог быть звук «е», а не «о», что характерно для южнорусских или белорусских говоров, где «хреп» произносили с «е» вместо «хрёп».

Социальный контекст прост: носитель фамилии, скорее всего, не принадлежал к знати. Фамилии на «-ин» из прозвищ — удел простого люда. Поскольку фамилия редкая, её географическая привязка может быть очень локальной — например, одно село или волость, откуда пошёл род Хрепрениных. В современных базах данных эта фамилия почти не встречается, что делает её настоящей редкостью.