Фамилия Хрисафис — редкий пример фамилии, образованной напрямую от полной личной формы, без типичных русских суффиксов -ов, -ев или -ин. Её основа — греческое мужское имя Хрисаф (Χρύσαφος), которое в свою очередь восходит к греческим словам «хрисафис» (χρύσαφις) — «златоцвет», или к «хрисафос» (χρύσαφος) — «золотой, златоносный». В православных святцах имя Хрисаф встречается как имя одного из мучеников, почитаемых церковью.

Фамилия имеет характерный для греческих фамилий суффикс -ис, который в русской передаче часто оформляется как -ис или -идис. Это окончание указывает на происхождение: в греческом языке суффикс -ίδης означает «сын» или «потомок». Таким образом, Хрисафис — буквально «сын Хрисафа». В русском бытовании фамилия осталась в неизменной форме, без адаптации под славянские модели склонения, что говорит о её сравнительно позднем появлении в русской среде — скорее всего, в XIX–XX веках, когда в Россию переселялись греки из Малой Азии, Приазовья или с Балкан.

Географически фамилия Хрисафис наиболее характерна для греческой диаспоры, но в России встречается в основном на юге — в Краснодарском крае, Ростовской области, а также в Крыму, где исторически сложились греческие общины. Встречается она и в среде понтийских греков, переселившихся в Россию в ходе репатриации. Носители фамилии, как правило, потомки священников, торговцев или ремесленников — греческое имя Хрисаф в церковной среде было распространено среди духовенства.

С точки зрения словообразования, фамилия Хрисафис стоит особняком: она не вписывается в типичные русские модели на -ов/-ев, а сохраняет греческую патронимическую форму. Это делает её легко узнаваемой и сразу указывает на греческое происхождение. В русском языке фамилия не склоняется по падежам в мужском роде (Хрисафис, Хрисафиса), хотя в греческой традиции ударение падает на последний слог — Хрисафис.