Фамилия Хрюхрюина — редкий и яркий пример того, как русская народная традиция прозвищ закрепилась в официальном родовом имени. В отличие от большинства фамилий, образованных от крестильных имён (Иванов, Петров) или профессий (Кузнецов, Мельников), эта фамилия восходит к звукоподражательному прозвищу. Основа «хрю» — подражание хрюканью свиньи. В русских говорах слово «хрю» и его производные («хрюкать», «хрюша») часто давали людям с хриплым голосом, грузной фигурой или тем, кто держал много свиней. Иногда прозвище «Хрюхрю» могло закрепиться за неряшливым человеком — по ассоциации со свиньёй как символом нечистоплотности.

Фамилия образована по типичной модели: прозвище Хрюхрю + суффикс -ин. Суффикс -ин в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей сын?» — Хрюхрюин, то есть сын (или потомок) человека по прозвищу Хрюхрю. Форма на -ин характерна для фамилий, образованных от основ, оканчивающихся на -а или -я, но здесь мы видим исключение: основа на -у (в прозвище Хрюхрю), поэтому фамилия звучит нестандартно. Встречаются также варианты Хрюхрюев (с суффиксом -ев, более логичным для основ на согласный), но форма Хрюхрюина закрепилась как женская или диалектная.

С географической точки зрения такие фамилии редки и, скорее всего, имеют локальное происхождение. В дореволюционных переписях населения фамилии с корнем «хрю» встречаются в северных и центральных губерниях России, где прозвища давали по внешним признакам или поведению. Сословная принадлежность носителей — почти всегда крестьяне или мещане, так как дворянские фамилии редко образовывались от таких откровенных прозвищ.

В современном русском языке фамилия Хрюхрюина сохраняет свою выразительность, хотя её носители, вероятно, сталкиваются с вопросами о происхождении. Ономастические словари (например, работы Б. Унбегауна) относят подобные фамилии к разряду «прозвищных», подчёркивая, что они не несут негативного оттенка — это просто фиксация живой народной речи. Если сравнивать с однокоренными фамилиями (Хрюкин, Хрюшкин, Хрюкалов), то Хрюхрюина выделяется удвоением основы, что усиливает звукоподражательный эффект и делает фамилию почти уникальной.