Фамилия Худайшукуров — яркий пример тюрко-персидского именослова, перешедшего в русскую фамильную модель. Её основа составная: первая часть «Худай» (от персидского «Хода» — Бог, Всевышний) и вторая — «шукур» (от арабского «шукр» — благодарность, хвала). Вместе имя-основа Худайшукур означает «благодарный Богу» или «восхваляющий Всевышнего». Такие теофорные (связанные с Богом) имена были распространены среди народов, исповедующих ислам, — особенно у татар, башкир, узбеков, казахов и других тюркских групп.

Русский суффикс -ов, добавленный к основе, — классический способ адаптации нерусских фамилий в Российской империи. Он указывает на принадлежность: «сын Худайшукура» или «из рода Худайшукура». Фамилия могла закрепиться за человеком, которого звали Худайшукур, или за его потомками. В среде крещёных татар и мусульман, переходивших в православие, такие фамилии часто фиксировались при переписях и рекрутских наборах.

Географически фамилия Худайшукуров встречается преимущественно в Поволжье (Татарстан, Башкортостан) и в Средней Азии (Узбекистан, Таджикистан). В русских документах XIX века её могли записывать с вариациями: Худайшукуров, Худайшукюров, Худайшукуровъ. Интересно, что вторая часть «шукур» родственна более известному имени Шукур (ср. фамилии Шукуров, Шукюров), а «Худай» встречается в фамилиях Худайбердиев, Худайназаров.

Сословная принадлежность носителей фамилии чаще всего была крестьянской или мещанской, хотя отдельные ветви могли принадлежать к духовенству (муллы) или купечеству. Точных данных о знаменитых носителях в открытых источниках нет — фамилия редкая и локальная.

Коротко: Худайшукуров — «сын того, кто благодарит Бога». Фамилия несёт в себе исламскую религиозную традицию, оформленную русским патронимическим суффиксом, и отражает многовековое взаимодействие тюркской, персидской и славянской культур.