Фамилия Хукеян — редкий случай для русского уха, и искать её корни стоит не в славянских землях, а на Кавказе. Это типичная армянская фамилия, образованная по одной из самых распространённых в армянском языке моделей — с помощью патронимического суффикса -ян (в старой орфографии -янц), который означает «принадлежащий к роду» или «потомок». Если убрать суффикс, остаётся основа «Хуке», которая и является ключом к происхождению.

Основа «Хуке» с большой вероятностью восходит к армянскому имени или прозвищу Хукес. В армянской ономастике имя Хукес (иногда в форме Хуки) — это уменьшительно-ласкательная форма от имени Ованес (армянский аналог Иоанна, то есть Ивана). Механизм такой: Ованес сокращался до Хо, Хохо, а затем через народную речь превращался в Хукес. Таким образом, Хукеян означает буквально «потомок Хукеса», то есть внук или правнук человека, которого в быту звали Хукес (по-русски — Иванович, но через армянскую фонетику).

Есть и менее очевидная, но вполне реальная версия, связанная с географией. В Армении и сопредельных регионах Турции встречаются топонимы с корнем «хук» (например, село Хукес или Хуки в исторической провинции Васпуракан). В таком случае фамилия Хукеян могла возникнуть как указание на выходца из этого места — «хукеец», то есть человек из Хукеса. Для армянской диаспоры, рассеянной по миру, такие «топонимические» фамилии не редкость: они помогали сохранить память о родовом селе.

По суффиксу -ян мы можем определить, что фамилия окончательно оформилась в XIX — начале XX века, когда армяне массово получали фамилии по отцовской линии. До этого в ходу были просто именования по отцу с окончанием -янц или -енц, которые со временем упростились до -ян. Носители фамилии Хукеян, скорее всего, происходят из западных областей исторической Армении (нынешняя восточная Турция) или из районов, куда мигрировали армяне после геноцида 1915 года — например, в Краснодарский край, Ростовскую область или Армению.

С точки зрения социолингвистики, фамилия не указывает на знатное или крестьянское происхождение — она равно могла принадлежать и ремесленнику, и священнику, и крестьянину. Единственное, что можно сказать с уверенностью: предки носителя фамилии были армянами, говорившими на одном из диалектов, где имя Ованес звучало как Хукес, а их род был достаточно велик, чтобы закрепить за собой такое отчество.