Фамилия Хушенский — редкий случай, когда географическая основа почти наверняка перевешивает прозвищную. В пользу этого говорит типично польский или западнорусский суффикс -ский, который в фамилиях такого типа чаще всего указывает на связь с местом: владельцем поместья, жителем села или выходцем из конкретного пункта.

Корень «Хуш-» с высокой вероятностью восходит к названию нескольких населенных пунктов. В Польше есть село Хуша (Chusza) в Подкарпатском воеводстве, а также Хушня (Chusznia). В Беларуси и на западе Украины встречаются топонимы вроде Хуша, Хущево. Фамилия Хушенский — это классическая модель «название места + -ский»: человек, владевший или живший в Хуше, получал прозвище «хушенский», которое затем закреплялось за его потомками. По той же схеме образованы фамилии Замойский (от Замостье), Острожский (от Острог).

Альтернативная версия — от личного прозвища «Хуша». В древнерусских диалектах слово «хуша» могло означать «скупой, жадный» или, в некоторых говорах, «неопрятный человек». Однако эта основа встречается крайне редко, и, в отличие от топонимов, не дает объяснения характерному суффиксу -енск-. Для прозвищных фамилий типичнее было бы окончание -ин (Хушин) или -ов (Хушов). Поэтому версия с географическим происхождением выглядит убедительнее.

Фамилия не относится к числу распространенных. Ее носители, скорее всего, имели шляхетское или мещанское происхождение на территориях бывшей Речи Посполитой. В Российской империи фамилии на -ский часто указывали на дворянский статус, но не всегда: так же могли зваться крестьяне, переселенные из деревни Хуша в другие губернии. Встретить Хушенских можно в записях XIX века по Волынской, Гродненской и Минской губерниям, а также среди польской эмиграции.