Фамилия Хюнен образована от аналогичного прозвища, которое восходит к немецкому слову Hüne. На русский язык оно переводится как «великан». Возможно, что это прозвище указывало на особенности телосложения предка. Так могли называть очень высокого человека. Кроме того, не исключено, что прозвище Хюнен получил физически крепкий, сильный человек.