Фамилия Киакпаев — редкая, и её происхождение уходит корнями в тюркские языки, скорее всего, в казахскую или башкирскую среду. Основа фамилии — имя или прозвище Киакпай. Первая часть, «киак», может восходить к тюркскому корню со значением «острый», «колючий» или же быть вариантом имени Кияк (встречается у казахов и киргизов). Вторая часть — «пай» (бай) — означает «богач», «господин», «хозяин». Таким образом, Киакпай — составное имя, которое можно перевести как «острый (или колючий) богач» или «владелец острого копья», что типично для древних тюркских имён-пожеланий, где бай добавляли для усиления положительного смысла.

Суффикс -ев указывает на русскую адаптацию фамилии по модели «чей?» — то есть «сын Киакпая». В тюркских языках такие фамилии часто образовывались без суффикса, но при контакте с русской администрацией в XIX–XX веках их русифицировали, добавляя -ов/-ев. Фамилия не дворянская и не купеческая, а скорее крестьянская или казачья — такие фамилии получали при переписях в Оренбургской, Уральской или Тургайской областях, где жили казахи и башкиры, переходившие на оседлость.

Географически Киакпаевы могли быть выходцами из Западного Казахстана или Южного Урала. Встречается фамилия и в Оренбургской области, и в Башкортостане. Поскольку основа имени редкая, носители фамилии, скорее всего, принадлежат к одному роду или небольшой родственной группе, а не к разным линиям. В отличие от распространённых фамилий вроде Иванов или Смирнов, Киакпаев почти не встречается за пределами тюркоязычных регионов бывшего СССР.

Споров о происхождении почти нет: версия с тюркским именем Киакпай — единственная правдоподобная. Альтернативные гипотезы, например, связь с монгольским «киак» (редкий вид растения) или с калмыцким «кяк» (козёл), слабы и не подкреплены историческими записями. Фамилия не имеет отношения к русским корням — это чистый пример тюркской антропонимики, адаптированной русским суффиксом.