Фамилия Киеков — редкий случай, когда географический маркер оказывается едва ли не важнее лингвистического. Она почти наверняка имеет тюркское происхождение и связана с башкирским или татарским миром, а точнее — с топонимом Киеки. В Башкортостане есть несколько населенных пунктов с таким названием (деревни Киеки, Киеково), и фамилия, скорее всего, образована от названия места жительства предка. Модель образования проста: к основе «Киек» добавили русский патронимический суффикс -ов, что типично для фамилий, которые фиксировались в метрических книгах и переписях у народов Поволжья и Приуралья.

Корень «кие-» в тюркских языках неоднозначен. В башкирском и татарском «киек» может означать «дикий», «глухой», «отдаленный», а также «дикое животное» или «зверь». Поэтому у фамилии есть и вторая, прозвищная версия: предка могли прозвать Киек — «дикарь», «нелюдим» или, наоборот, «ловкий охотник на дичь». В пользу этого говорит то, что прозвища с таким корнем встречаются в тюркоязычной среде, но географическая привязка (наличие деревни Киеки) делает первую версию более весомой: фамилии от названий сел в этой среде были массовым явлением.

Суффикс -ов указывает на то, что фамилия оформлялась уже в русской административной традиции, скорее всего, в XIX веке. В отличие от более архаичных башкирских фамилий на -ин или -ый, Киеков — пример поздней паспортизации, когда человека записывали по отцу: «Киеков сын» или «из деревни Киеки». Встречается фамилия почти исключительно в Башкортостане и соседних регионах (Оренбургская, Челябинская области), что подтверждает ее локальный характер.

Спорных версий немного: иногда корень пытаются возвести к арабскому «кияк» (мера веса) или к казахскому «киек» (кромка, край), но эти гипотезы слабые — они не объясняют ни ареала фамилии, ни ее массовости именно в Башкирии. В ономастических справочниках (например, в работах по башкирским фамилиям) Киеков обычно относят к группе топонимических фамилий, что и следует считать основным объяснением.