Фамилия Кинтонова — редкая и неочевидная по корню. Сразу заметна модель: суффикс -ов- и окончание -а выдают женскую форму, мужская — Кинтонов. Основа «Кинтон» в русском языке не встречается ни как имя, ни как нарицательное слово. Это первый ключ: фамилия не исконно русская, а скорее всего, заимствованная или образованная от иноязычного прозвища.

Самый вероятный источник — тюркские языки. В них корень «кин» (кюн, гюн) означает «солнце», «день» или «свет». Второй компонент «тон» может восходить к слову «тун» — «ночь» в некоторых тюркских наречиях, или к «тонг» — «замерзший», «холодный». Сложносоставное прозвище вроде «Кинтон» могло означать «светлая ночь», «солнечный день» или, с другой огласовкой, «солнечный мороз». Прозвища по природным явлениям у тюркских народов встречаются часто. Фамилию могли дать человеку с таким прозвищем при переходе в русскую культуру, например, в среде татар, башкир или народов Кавказа.

Менее вероятная, но возможная версия — от грузинского имени Кинтон, которое является уменьшительной формой от Кинтос (в грузинском «сокровище»). В таком случае фамилия могла возникнуть у грузин, принявших русскую фамильную модель с суффиксом -ов. Однако грузинские фамилии обычно заканчиваются на -дзе, -швили, -ия, поэтому версия с тюркским корнем выглядит убедительнее.

Географически фамилия Кинтонова может встречаться в Поволжье, на Урале или в Сибири — регионах, где веками жили тюркские народы рядом с русскими. Сословно предки скорее всего были крестьянами или казаками, так как фамилии с неочевидной тюркской основой редко встречаются у дворянства, которое чаще носило фамилии от церковных имен или географических названий.

Итог: корень «Кинтон» — это прозвище по световому или погодному явлению, скорее всего, из тюркского языка. Фамилия — результат межэтнического контакта, когда прозвище или имя из другой культуры оформили по русскому образцу с суффиксом -ов.