Фамилия Кипаитуло — редкая и территориально привязанная. Её носители почти без исключения происходят с Дальнего Востока России, а точнее — из числа донских, забайкальских или амурских старообрядцев (семейских). Основу фамилии составляет тюркское или монгольское прозвище, записанное через русское ухо.

Разберём слово по частям. Корень «кипай-» или «кипа-» восходит к тюркскому «кипа» — «мешок, котомка», либо к более редкому «кипай» — «собиратель, запасливый человек». Суффикс «-туло» — это диалектный, сибирский вариант фамильного форманта, характерного для региона: «-тулов» / «-туло». В русской ономастике такие окончания встречаются у фамилий, возникших из прозвищ на -тул (например, Копытулов, Баратулов). Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Кипаи́туло.

По смыслу прозвище Кипаитуло могло означать «человек с котомкой» — странник, бродячий торговец или переселенец, носивший скарб в мешке. В среде семейских, которые в XVIII–XIX веках массово переселялись в Забайкалье, такое прозвище было бы вполне уместно: оно фиксировало характерный признак быта или род занятий. Менее вероятна версия, связывающая фамилию с греческим «кипарис» (через «кипаи»): для сибирских старообрядцев это слишком книжно и нетипично.

Фамилия не имеет окончания -ов/-ев, что указывает на её позднюю фиксацию (вторая половина XIX века) и на то, что она осталась в форме прозвища без русификации. Встречается в основном в Бурятии и Забайкальском крае. Носителей мало — не более нескольких десятков семей. Если вы встретили Кипаитуло за пределами Сибири, скорее всего, это потомок переселенцев начала XX века в ходе столыпинской аграрной реформы.