Фамилия Кипус — одна из тех, что заставляют задуматься: настолько она не похожа на привычные русские фамилии с суффиксами -ов или -ин. Её основа сразу выдаёт нерусское происхождение. Скорее всего, перед нами фамилия, пришедшая из польского, украинского или белорусского языков, где суффикс -ус встречается гораздо чаще, чем в великорусской среде. В польской ономастике, например, он мог образовывать фамилии от прозвищ или названий профессий. Самый очевидный кандидат на роль корня — польское слово «kipa» или «kipieć», что значит «кипеть» или «бурлить». В таком случае прозвище Кипус мог получить человек вспыльчивый, горячий, с кипучим темпераментом. Однако есть и более прозаичная версия: в польских говорах «kipa» — это просто «куча», «стог» или «копна». Тогда прозвище могло относиться к крестьянину, который работал с сеном, или к человеку крепкого, плотного телосложения.

Вполне вероятно, что фамилия имеет и тюркские корни. В тюркских языках есть слово «kip» (или «kep») со значением «форма», «образ», «вид». В сочетании с уменьшительным суффиксом -ус это могло дать прозвище, означающее «маленький», «ладный» или «похожий на кого-то». Но эта версия менее распространена, так как фамилии на -ус в тюркской среде нетипичны. Географически фамилия Кипус встречается в основном на западе России, в Беларуси и на Украине, что подтверждает её западнославянское или балтийское происхождение. Встречаются также варианты написания Кипусь, что указывает на мягкое произношение, характерное для польского языка.

Интересно, что фамилия Кипус практически не имеет однокоренных «родственников» в русской среде. Нет распространённых вариантов вроде Кипов или Кипин. Это говорит о том, что фамилия либо была принесена переселенцами из Речи Посполитой, либо образовалась в изолированной местности. Сословно носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или мещанами, так как дворянские фамилии в этой части Европы чаще оформлялись через суффиксы -ский/-цкий. Таким образом, предки современного Кипуса — человек с живым, возможно, взрывным характером, либо крестьянин, чья жизнь была связана с полевыми работами. Фамилия сохранила свою первоначальную форму без русификации, что делает её редким и выразительным свидетельством культурного влияния западных соседей.