Фамилия Кизогян — яркая примета армянского происхождения, и её разбор стоит начать с суффикса. Формант -ян (в старой орфографии -янц) — самый распространённый патронимический суффикс в армянских фамилиях, указывающий на принадлежность к роду: «из рода такого-то». В русской традиции он часто передаётся как -ов/-ев, но в исконном виде сохранился у многих армянских фамилий.

Основа фамилии — Кизо. Здесь возможны две основные версии, и обе ведут к личному прозвищу. Первая: Кизо — это краткая форма от армянского имени Кизог или Кизоган. Вторая, более вероятная, связывает основу с диалектным словом «киз» — в некоторых армянских говорах так называли козла или козу. Такие прозвища по животным были распространены: они могли указывать на характер человека (упрямый, бодливый) или на род занятий — пастуха, козопаса.

В пользу прозвищной версии говорит и то, что в армянской ономастике фамилии на -огян (вариант -ян) нередко образовывались именно от бытовых, а не от канонических имён. Буквально Кизогян означает «потомок Кизо», где Кизо — прозвище пастуха или человека с «козлиными» чертами характера.

Географически фамилия Кизогян встречается у армян, переселившихся на Кубань и в Ростовскую область в XIX–XX веках, а также в диаспорах США и Франции. В самой Армении она редка, что типично для прозвищных фамилий, закрепившихся в конкретной локальной группе. В написании возможны варианты через «е» (Кезогян) — это следствие разных диалектов произношения, но корень остаётся тем же.