Фамилия Клавит образована от аналогичного прозвища, которое, предположительно, связано с латышским словом klauvēt «стучать, стучаться». Таким образом, прозвище могло указывать на профессию его носителя, например, он был плотником или ночным сторожем. Однако не исключено, что это именование этимологически связано с литовским словом klava – «клен». В этом случае именование Клавит было мирским именем – в старину были распространены имена, образованные от названий растений.