Фамилия Клиницкие — одна из тех, что указывает на тесную связь предка с землёй, на которой он жил или которую обрабатывал. В основе её лежит не имя, не ремесло, а топоним или прозвище, и разобраться здесь можно с двух сторон.

Самая прямая версия отсылает к городу Клин в Московской области. Этот древний город на реке Сестре известен с XIII века, а в 1482 году вошёл в состав Московского княжества. История его бурная: в 1569 году Клин сильно пострадал от опричнины, позже Иван Грозный завещал его сыну, а затем он стал вотчиной дома Романовых. С 1785 года Клин — уездный город, получивший регулярный план застройки, а в 1851 году через него прошла одна из первых железных дорог России — Николаевская. Если предок носил фамилию Клиницкий, он или его отец могли быть выходцами из этих мест. Суффикс -ск- в фамилии — типичный признак «географического» происхождения: так называли дворян по их владениям или простых людей — по месту, откуда они пришли. Форма Клиницкие (во множественном числе) характерна для польской, белорусской или западнорусской традиции, где фамилия указывала на целый род или шляхетскую семью.

Вторая версия уводит от города к нарицательному слову «клин». В старину клином называли не только инструмент, но и участок поля — узкую полосу земли, вклинившуюся в чужие владения или лес. Такое прозвище мог получить человек, живший на отшибе, на краю общинных угодий, или, например, лесничий, который вырезал делянки в лесу. В этом случае фамилия образовалась напрямую от прозвища Клин через добавление того же суффикса -ск-, означающего принадлежность: «Клиницкий» — сын или потомок того, кого звали Клин.

Точное время возникновения фамилии Клиницкие сейчас установить сложно. Процесс формирования фамилий у славян был долгим и неравномерным: у шляхты и знати они закреплялись уже в XV–XVI веках, у крестьян — нередко только к XIX веку. Однако сама модель (основа Клин- + суффикс -ицк-) указывает на достаточно ранний пласт, возможно, XVI–XVII столетий, когда такие «географические» фамилии активно распространялись на землях Речи Посполитой и Московского государства.