Фамилия Клотилов — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано с конкретным ремеслом или бытовой деталью. В её центре лежит слово «клотик» — так на русском Севере и в некоторых областях называли деревянный или металлический набалдашник на верхушке мачты, через который пропускали снасти. Человек, делавший эти детали или следивший за их состоянием, мог получить прозвище Клотик. От него с помощью патронимического суффикса -ов образовалась фамилия Клотилов: «сын Клотика».

Есть и вторая, менее вероятная версия. В диалектах «клотик» могло означать небольшой клок, пучок, клочок — например, шерсти или сена. Тогда прозвище дали бы человеку с неряшливой, торчащей в разные стороны шевелюрой или тому, кто постоянно возился с клочьями (валяльщик, шерстобит). Но морская и судостроительная этимология убедительнее: слово «клотик» в этом значении зафиксировано в словарях с XVIII века и широко бытовало в поморских и волжских говорах.

Обратите внимание на суффикс -ов, а не -ин. Это значит, что исходное прозвище оканчивалось на согласный (Клотик), а не на -а или -я. Если бы предка звали Клотила, фамилия была бы Клотилин. Типичная модель для русских фамилий из северных и центральных губерний.

Географически фамилия редкая, встречается точечно. Наибольшая концентрация носителей — в Архангельской области и на Вологодчине, что косвенно подтверждает «морскую» версию: Поморье, корабельное дело, река Северная Двина. Встречается также в Сибири, куда переселенцы с Русского Севера уходили в XVII–XIX веках. В дворянских родословных книгах фамилия не значится: это крестьянский или мещанский род, люди мастеровые, связанные с рекой и лесом.

Однокоренные фамилии — Клотиков, Клотихин, Клотищев — встречаются, но все они ещё реже. Клотилов среди них самый частый, хотя в списке тысяч самых распространённых русских фамилий его нет.