Фамилия Клоцкина — женская форма от Клоцкин. В основе фамилии лежит прозвище или нецерковное имя Клоцка. Слово «клоцка» в русских говорах имеет несколько значений, но самое вероятное — «колода», «чурбан», «короткий обрубок дерева». Так могли назвать человека коренастого, невысокого и плотного, с крепкой фигурой. В некоторых регионах «клоцкой» называли неуклюжего, медлительного человека, что тоже могло стать причиной прозвища.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Клоцкин — сын Клоцки. Такая модель типична для русских фамилий от основ на -а/-я (ср. Пушкин, Ильин). Это говорит о том, что фамилия сформировалась в среде, где было распространено отчество на -ин, то есть в северных и центральных областях России, а также в некоторых регионах Поволжья.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с идишским словом «клоц» (деревянный чурбан, болван), и тогда Клоцкин могла быть фамилией еврейского происхождения. Однако в этом случае более типичной была бы форма Клоц, а не Клоцка. Русская огласовка и суффикс -ин делают версию славянского прозвища более правдоподобной.

Фамилия редкая, в списках дворянских родов не встречается. Скорее всего, предки носительницы фамилии были крестьянами или посадскими людьми, а прозвище Клоцка дали по внешности или характеру. В современной России фамилия Клоцкина встречается эпизодически, в основном на северо-западе и в центре страны.