Фамилия Клубякина — женская форма, а её основа — мужская фамилия Клубякин. Эта фамилия редкая и неочевидная: на слух она напоминает что-то связанное с клубами дыма или клубящимся туманом, но в русской ономастике за таким звучанием часто скрывается прозвище или профессия, а не природное явление.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»). Значит, предка звали Клубяка. В русских говорах слово «клубяка» или «клуб» могло означать нечто сбитое, спутанное, округлое. Например, в северных и сибирских диалектах «клуб» — это моток ниток, клубок, а «клубяка» — возможно, прозвище человека, который постоянно что-то сматывает, путает или, напротив, аккуратно складывает (прядильщик, ткач, вязальщик сетей). Прозвища по роду занятий в русской среде давали часто, и такое объяснение выглядит правдоподобнее, чем связь с глаголом «клубиться», который в переносном смысле для человека почти не употреблялся.

Есть и другая версия, более редкая: в некоторых говорах «клубяка» — это вариант слова «клуша» (наседка, курица). Тогда прозвище могло достаться заботливому, хлопотливому человеку или, наоборот, тому, кто суетится и «клубится» вокруг хозяйства. Но эта гипотеза слабее, так как переход «клуша» в «клубяка» нехарактерен для русской диалектной фонетики.

Географически фамилия Клубякин встречается в основном в центральных и северных областях России (Вологодская, Архангельская, Костромская области), где были сильны традиции льноводства и ткачества. Это косвенно подтверждает версию о прозвище, связанном с обработкой нитей и пряжи. В сословном отношении носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками, а не дворянами — суффикс -ин в сочетании с диалектной основой типичен для простонародных родовых именований.

Таким образом, фамилия Клубякина донесла до нас прозвище предка, который либо занимался сматыванием ниток, пряжи, либо получил его за манеру поведения — суетливую, «клубящуюся». В любом случае, это редкий случай, когда фамилия звучит поэтично, а корни у неё вполне прозаические, ремесленные.