Фамилия Клюдт — редкий случай, когда русская по форме фамилия имеет очевидные немецкие корни. Она образована от немецкого прозвища Klūte, что значит «глыба» или «ком». Скорее всего, такое прозвище давали человеку за внешность: полному, грузному или неповоротливому. В средневековой Германии прозвища часто были прямыми и без обиняков описывали человека, так что «глыба» — характеристика вполне конкретная.

Но есть и другая версия, не менее правдоподобная. Прозвище Клюдт могло относиться к «профессиональным» именованиям. В этом случае предок был шахтером, камнетесом или работал с тяжелыми глыбами — добывал или обрабатывал камень. Оба значения не противоречат друг другу: в одном случае прозвище описывало внешность, в другом — род занятий, а иногда и то и другое сливалось в одном слове.

Фамилия оформлена по русской модели: к немецкой основе добавился нулевой суффикс, и она стала склоняться как существительное мужского рода. Интересно, что фамилия Клюдт не получила типичных русских окончаний -ов или -ин, а сохранила «голый» корень — это указывает на относительно позднее появление в русской среде или на то, что носители долго сохраняли немецкое написание. Встречается она в основном в регионах, куда в XVIII–XIX веках приглашали немецких специалистов (горное дело, инженерное дело), что косвенно подтверждает «профессиональную» версию происхождения.