Фамилия Кодоненко — характерный пример украинской модели фамилий с суффиксом -енко. В украинской ономастике этот суффикс исторически означал «сын» или «потомок», то есть Кодоненко — буквально «сын Кодона». Такая модель была особенно распространена в Левобережной Украине, на Полтавщине и Черниговщине, и закрепилась как фамилия уже в XVI–XVII веках.

Основа фамилии — прозвище Кодон. Здесь возможны две версии, и обе имеют право на существование. Первая: Кодон — производное от греческого слова «кодон» (колокол, звонок). В церковной среде так могли называть звонаря или человека с громким, звонким голосом. Вторая, более бытовая, связывает прозвище с диалектным «кодола» — цепь или верёвка, которой привязывают скотину. В этом случае Кодоном могли прозвать пастуха, либо человека, который носил длинные, путающиеся волосы (по ассоциации с путами). В русских говорах встречается и слово «кодол» — канат, что тоже отсылает к ремеслу или внешнему признаку.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые закрепились в великорусских землях, Кодоненко сохранило типично украинский суффикс, указывающий на происхождение именно с территории современной Украины. При этом фамилия редкая: она не входит в списки самых распространённых украинских фамилий, что говорит о локальном, возможно, односельском происхождении — от прозвища одного конкретного человека, которое передалось его потомкам.

Сословно носители фамилии Кодоненко, скорее всего, относились к казачеству или крестьянству. В реестрах Запорожского войска и метрических книгах XVIII–XIX веков такие фамилии на -енко фиксировались у казацкой старшины и рядовых казаков, но чаще — у свободных сельских обывателей. Дворянских родов с такой фамилией не известно.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Кодолов, Кодонцев, Кодонский — показывает, что Кодоненко стоит особняком: суффикс -енко не позволяет путать его с русскими или польскими вариантами. Это чисто украинская словообразовательная модель, и если вы носите эту фамилию, ваши корни с большой вероятностью ведут в украинское село, где жил человек по прозвищу Кодон — звонкий или цепкий.