Фамилия Коэюбченко — одна из тех, где написание скрывает исходную форму. Первое, что бросается в глаза: сочетание «коэ» в начале. В русской ономастике это нетипично. Скорее всего, перед нами фонетическая или орфографическая трансформация более привычного корня «Козюб» или «Казюб». Вероятно, фамилия образована от прозвища Козюба — в украинских и южнорусских говорах так могли называть человека с козлиной (козлиной бородкой) или же того, кто упрям, как козёл. Суффикс «-енко» (вместо ожидаемого «-ко» — из-за мягкого «б») указывает на типичную украинскую модель: «сын Козюбы» или «потомок Козюбы». То есть носитель фамилии Коэюбченко — буквально «Козюбченко», где начальное «Коз-» через диалектное произношение превратилось в «Коэ-».

Вторая версия, менее вероятная, но возможная: основа «коэ» может восходить к тюркскому «кой» (овца) или «коя» (баран). Тогда прозвище Коэюб — «овцевод» или «тот, кто с овцой». Но для украинской среды такая этимология экзотична, и суффикс «-енко» твёрдо привязывает фамилию к восточнославянскому ареалу. Поэтому версия с «козой» или «козлиной» — основная.

Географически фамилия Коэюбченко — редкая. Она почти не встречается в центральных областях России, зато может быть локализована в Черниговской, Полтавской или Харьковской губерниях, где украинские фамилии на «-енко» особенно распространены. Написание с «э» вместо «е» или «ё» — скорее всего, результат ошибки при записи в метрических книгах или советских паспортах: писарь записал на слух «Коэюб» вместо «Козюб», а потом форма закрепилась.

Социальный контекст прост: предки Коэюбченко — скорее всего, крестьяне или казаки. Фамилия не дворянская, не духовная, образована от прозвища, а не от имени или названия профессии. Это указывает на то, что родоначальник получил своё прозвище за внешность или характер — упрямство, бородку, может быть, даже за какой-то случай, связанный с козой. В целом, Коэюбченко — типичный пример того, как устная традиция и ошибки письма создают уникальный облик фамилии, которую сегодня не спутаешь ни с какой другой.