Фамилия Комаленков — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного указания на профессию или внешность, и её разбор требует внимания к суффиксальной модели и возможным диалектным основам.

Словообразовательный костяк фамилии — суффикс -енков. Он характерен для южнорусских и украинских территорий, где часто заменял великорусское -ов или -ин. Комаленков — это типичная «патронимическая» фамилия, то есть образованная от имени или прозвища отца через притяжательное прилагательное: «чей сын?» — Комаленков, то есть сын Комáленка. Сама основа «Комáленко» — это, скорее всего, уменьшительная форма от имени или прозвища Комáл (или Комáля). Такой суффикс -енко в украинской традиции означает «маленький» или «сын» (ср. Шевченко — сын Шевца). Таким образом, Комаленков — это русифицированная форма украинской фамилии Комáленко, адаптированная под русскую грамматику (добавлением -ов) для склонения.

Корень «Комал-» — самый спорный. Первая и наиболее правдоподобная версия связывает его с диалектным словом «комáл» или «комáлый». В южнорусских говорах, особенно на границе с Украиной, «комáлый» означало «короткий», «куцый», «обрубленный». Так могли прозвать человека невысокого роста, с короткой конечностью или того, кто носил короткую одежду. Прозвище Комáл могло быть дано за физическую особенность.

Вторая версия, менее распространённая, но имеющая право на существование, — от тюркского имени или прозвища. У тюркских народов (например, у башкир или татар) существует имя Комал, восходящее к арабскому «камаль» — «совершенство». Однако для русской фамилии эта версия слаба: в центральной России фамилии на -енков от тюркских имён редки, а на юге, где фамилия могла возникнуть, скорее бы появилась форма Комалов.

Третья, чисто гипотетическая версия — от слова «ком» (комок, ком земли). В этом случае прозвище Комал могло относиться к человеку плотного, «комковатого» телосложения. Но эта версия не подкрепляется словообразовательной нормой: от «ком» естественнее было бы образовать Комов или Комков.

Географически фамилия Комаленков тяготеет к областям, где украинское влияние было сильным: Брянская, Курская, Белгородская, Воронежская области, а также юг России, куда переселялись украинские крестьяне. В дореволюционных списках она почти не встречается, что говорит о её поздней фиксации: большинство носителей получили фамилию уже после отмены крепостного права, когда патронимы на -енко начали массово переделывать в -енков для единообразия русских документов.

Итак, предок современных Комаленковых, скорее всего, носил прозвище Комал (коротышка, куцый) на украинских или южнорусских землях. Его сына называли Комáленко, а уже внук, попав в русскую бюрократическую среду, стал Комаленковым. Фамилия сохранила след диалектной лексики, которая сегодня почти забыта.