Фамилия Комендяк — редкая, и её происхождение вызывает споры среди ономастов. В ней нет привычного славянского суффикса -ов или -ин, что сразу указывает на иную модель образования. Скорее всего, это фамилия украинского или белорусского происхождения, где распространён суффикс -як, обозначающий принадлежность к чему-либо или носителя признака.

Основа «коменд-» может восходить к нескольким корням. Самая прямая версия — от слова «коменда» или «комендант», но не в современном военном значении, а в польском или западнорусском диалектном: так могли называть управляющего, смотрителя или приказчика. В таком случае Комендяк — «сын коменданта» или «помощник управляющего». Однако есть и другая, более бытовая гипотеза: в некоторых говорах «комендой» называли суетливого, беспокойного человека, того, кто постоянно «командует» или вмешивается не в своё дело. Прозвище могло закрепиться за таким человеком, а затем перейти в фамилию.

Не исключено и западное влияние. Фамилия могла возникнуть на территории бывшей Речи Посполитой, где польское komenda (команда, управление) дало множество производных. В таком случае Комендяк — это вариант фамилии Коменда или Комендант, адаптированный под местную фонетику. Суффикс -як типичен для Подляшья, Волыни и Галиции, что косвенно подтверждает географию фамилии: большинство носителей Комендяк сегодня живут на западе Украины и в приграничных районах Беларуси.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Комендантов, Коменда, Комендюк — показывает, что все они образованы от одного корня, но разными способами. Комендяк — самый «западный» вариант, где суффикс -як выполняет ту же роль, что и -ук/-юк на востоке Украины: указывает на потомка или человека, связанного с основой. Таким образом, предок носителя фамилии мог быть либо сыном управляющего, либо сам получил прозвище за привычку распоряжаться. Точнее сказать сложно без генеалогического исследования, но обе версии укладываются в логику народного словообразования.