Фамилия Коморовская — женская форма фамилии Коморовский, а та, в свою очередь, образована от названия населённого пункта. Самый очевидный и частый вариант происхождения — от топонимов Коморово, Комарово или Коморов. Таких сёл и деревень в Польше, Беларуси и на западе России было немало. Названия эти, как правило, связаны со словом «комар»: либо местность была болотистой, комариной, либо в основе лежало прозвище Комар, которое давали человеку с тонким, «писклявым» голосом или назойливому, приставучему в общении.

Фамилия типична для польской и западнорусской (белорусской) шляхты. Суффикс -ский/-цкий указывает на дворянское происхождение или на принадлежность к землевладельцам, владевшим поместьем с таким названием. Поэтому Коморовские — это, скорее всего, потомки мелкопоместных дворян, получивших фамилию по своему имению. В Речи Посполитой этот род был довольно известен: например, Коморовские герба Корчак или герба Долэнга.

Встречается и менее очевидная версия: основа могла быть не от «комара», а от польского «komora» — «камера, кладовая, амбар». В этом случае фамилия указывала бы на предка, который служил ключником или смотрителем при складах, либо жил рядом с хозяйственной постройкой. Однако эта версия уступает «комариной» по распространённости.

В русской среде фамилия могла появиться благодаря выходцам из польско-литовских земель, особенно после разделов Польши. В современном русском языке ударение обычно падает на второй слог — Комо́ровская, хотя в польском оригинале оно могло быть на предпоследнем.