Фамилия Комозя — редкая и неочевидная, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от большинства русских фамилий, она не оканчивается на -ов, -ин или -ский, что сразу указывает на её возможное нерусское или диалектное происхождение, либо на то, что перед нами — прозвищная фамилия, застывшая в форме именительного падежа.

Скорее всего, основа фамилии — прозвище Комозя. В русских говорах слово «комозя» могло означать неуклюжего, неповоротливого человека, того, кто «комкает», делает всё неловко. В некоторых областях «комозить» — значит возиться, копаться, делать что-то медленно и с трудом. Так могли прозвать ребёнка или взрослого за медлительность либо, наоборот, в шутку — за суетливость. Фамилии такого типа (на -я) характерны для украинской и белорусской традиции, где прозвища вроде Комозя, Неборак, Заброда легко становились фамилиями без дополнительных суффиксов. В России такие формы встречаются реже и обычно в южных или западных регионах.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с коми-зырянским или финно-угорским языковым субстратом. В коми языке есть слово «ком» (человек, мужчина), а «озя» могло быть диалектной формой. Однако это лишь гипотеза, не подкреплённая устойчивой традицией: фамилия Комозя не фиксируется как распространённая среди народов Севера.

Встречаемость фамилии крайне низкая. По открытым данным, она единично фиксируется в Краснодарском крае, на Украине и в Беларуси. Это подтверждает версию о диалектном прозвищном корне: такие фамилии редко уходят далеко от места своего возникновения.

В написании фамилии возможна вариативность — Комозя, Комозья, Комозе. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Комо́зя. Если ваши предки носили эту фамилию, стоит искать их в документах XIX века среди крестьян или мещан западных губерний Российской империи — именно там прозвищные фамилии без суффиксов были нормой.