Фамилия Комжаров — редкий случай, когда в основе лежит не профессия и не крестильное имя, а конкретный предмет одежды. Корень «комж» восходит к слову «комжа» или «комжица» — так на Руси называли короткую верхнюю рубаху, подрясник, который носили священнослужители. В некоторых говорах слово имело более широкое значение: «комжа» могла означать просто ветхую или рабочую одежду. Суффикс -ов указывает на принадлежность: Комжаров — буквально «сын Комжара», то есть человека, которого прозвали за привычку носить такую рубаху или за то, что он её шил.

Вторая, менее очевидная версия связывает фамилию с диалектным глаголом «комжать» — мять, сжимать, делать складки. В этом случае прозвище Комжар могли дать портному, который собирал ткань в сборку, или человеку с привычкой комкать что-либо в руках. Однако первая версия — с одеждой — выглядит убедительнее, потому что у слова «комжа» есть прямой предметный смысл, а глагол «комжать» встречается реже и в основном в северных говорах.

Фамилия явно недворянская: в старых родословных книгах Комжаровы не значатся. Это типичная крестьянская или посадская фамилия, которая могла возникнуть в среде ремесленников, портных или причетников. Интересно, что у фамилии есть близкие «родственники» — Комжаков, Комжин, Комжиков. Если Комжаров образован от прозвища Комжар (с суффиксом -ар, обозначающим деятеля), то Комжин — напрямую от слова «комжа» через притяжательный суффикс -ин. Такое соседство наводит на мысль, что фамилия могла возникнуть в одном регионе, где слово было в ходу, — скорее всего, в центральных или северных губерниях России.

Встречаемость Комжаровых невысока, но стабильна: фамилия фиксируется в переписях XIX века в Вятской, Костромской и Ярославской губерниях. Современные носители живут в основном в центральной России и Поволжье.